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Cours.Semaine7 History

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Sujet bio-info (HMM modélisation): lien

Sujet alternatif pour coder par vous-même Viterbi: lien

  • Soumission des TME : lien
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Sujet principal bio-info pour le décodage de séquence ADN (HMM modélisation): 2020_tme7.zip

Sujet supplémentaire pour reprendre les données du TME 6 en version HMM: 2020_tme7_2.zip

Les sujets supplémentaires sont évidemment totalement facultatifs

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  1. Retour sur les stratégies de résolution MMC : approches récursives {$\alpha, \delta, \Psi$}
  2. Baum-Welch simplifié : un algorithme intuitif
  3. Baum-Welch complet (EM) : résolution d'un problème non convexe, initialisation(s), critère d'arrêt
  4. Observations continues, modèles multi-variés :
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Sujet : lien

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Sujet bio-info (HMM modélisation): lien

Sujet alternatif pour coder par vous-même Viterbi: lien

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Poly: pdf

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Recueil: pdf

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Recueil de TD : cf semaine 1 (poly complet)

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Recueil: pdf

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Recueil: pdf

October 29, 2014, at 10:54 AM EST by 132.227.206.222 -
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Cours 7: chaine de Markov cachée

Contenu du cours

  1. Reflexions sur l'évaluation et les biais d'évaluation des algorithmes probabilistes :
  2. Rappels sur les chaines de Markov :
  3. Introduction des modèles MMC (cachés) : Formalisation, Expressivité
  4. Problèmes classiques des MMC (Rabiner) :
  5. Evaluation : Algorithme alpha (forward)
  6. Décodage : Algorithme delta (forward) + décodage (backward) = Viterbi

Poly: pdf

TD

Recueil: pdf

TME

Sujet : lien

  • Soumission des TME : lien

Bibliographie et références utiles

  • Rabiner : tutorial on HMM lien vers le pdf